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主要职能:
（一）贯彻执行中央、省和广州市有关农业、蔬菜、水果、花卉业和农村经济工作的方针、政策、法规；协调有关部门制订涉农规定，并组织检查、监督实施。
（二）制订本市农业、蔬菜、水果、花卉发展规划和年度计划，负责组织实施并督促检查执行情况。
（三）负责“米袋子工程”和“菜蓝子工程”及水果、花卉业中有关主管行业的组织实施工作；负责种植业开发的立项审批工作，以及农作物植物保护工作，组织各项创高产活动，指导保护耕地，整治农田，改造中低产田。
（四）组织有关农业科技研究和推广工作，抓好农村科技人才，管理人才的培训工程。
（五）协调各镇和有关部门实施农村经济体制改革，会同有关部门指导协调农村生产、流通和对外经贸以及扶持山区镇、贫困地区建设工作。
（六）管理生产物资、支农资金和农业发展基金，协调有关部门管理农用土地工作。
（七）负责主管农业的资源、国内植物检疫（验）、农业生态环境保护和农村能源工作。
（八）农业执法、农业技术推广，审批《农作物种子生产许可证》、《农作物种子经营许可证》；代办《农药经营许可证》、《农药经营上岗证》。
（九）管理局属下事业单位，指导有关学会和协会工作。
（十）承办市政府和上级农业部门交办的其它工作。

科室设置:
（一）办公室 
（二）政策法规科 
（三）财务科 
（四）农村经济体制与经营管理科 
（五）发展计划与信息科
（六）科技教育科
（七）农业综合开发科 
（八）种植业管理科
（九）蔬菜科

审批事项:
1.负责对其他部门政策法规中涉及农业、农民和农村经济条款的审批
2.建设项目环境影响报告书的农田环保方案审批
3.负责农药经营许可证、上岗证、植保员上岗证、种子经营许可证的审批